Analizy szlaków docelowych genów

ZnalezionePoprzez integrację nakładającego się sekwencjonowania RNA mRNA i miRNA w sparowanych zachowanych i uszkodzonych próbkach chrząstki OA, przedstawiliśmy pierwszy kompleksowy, specyficzny dla OA, interakcji miRNA. W tym celu zidentyfikowaliśmy 142 miRNA i 2387 genów o istotnym DE między uszkodzoną i zakonserwowaną chrząstką. Dzięki rygorystycznemu schematowi priorytetyzacji stworzyliśmy nowy, spokrewniony z OA, miRNA, proton z 62 miRNA i ich 238 prawdopodobnie docelowych mRNA. Kolejne analizy szlaków docelowych genów miRNA wykazały znaczące wzbogacenie genów, które działają między innymi w pozytywnej regulacji aktywności GTPazy i rozwoju układu nerwowego. Aby umożliwić biologiczną interpretację niektórych wyróżnionych klastrów, przeprowadzono eksperymenty walidacji funkcjonalnej z antagomirami i mimikami. Zaobserwowaliśmy, że naśladowcy miR-143-3 p, z pojedynczą korelacją z genami GHR, SMAD3, AMIGO1 i DCAKD, wykazywali konsekwentny odwrotny wpływ na ekspresję genów. Z drugiej strony, antagomirs i imitacje miR-99a-3p i miR-329-3 p, oba sparowane z genami WNT9A, FZD1 i GDF6 , miały stały wpływ na ekspresję genu, ale w zmiennych kierunkach. Łącznie, nasze dane sugerują, że oddziałujące poziomy miRNA wspólnie wpływają na ekspresję genów w chrząstce, ale są przykładem złożoności funkcjonalnej weryfikacji sieci miRNA-mRNA.
[patrz też: telegazeta ogłoszenia, przychodnia nova chojnice, przychodnia cepelek ]